Lete na Letališče Jožeta Pučnika Ljubljana je družba ustavila konec marca. Pred tem je med mestoma letela štirikrat tedensko. V času prekinitve se prevoznik usmerja v krepitev povezav z drugimi mesti v regiji.
Po napovedih bo Flydubai povečal število letov v Beograd, kjer bo od maja letel desetkrat tedensko. Povezavo z Zagrebom naj bi konec maja vzpostavil vsak dan, medtem ko bo število letov v Sarajevo postopno povečal.
Na letalske povezave iz Ljubljane vplivajo tudi odločitve drugih prevoznikov. Lufthansa je zaradi zmanjševanja stroškov začasno ustavila lete med Ljubljano in Münchnom, povezava naj bi bila znova na voljo 1. junija.